Ocorre em 6 etapas, onde uma célula tronco percorre uma sequência de diferenciação e aprimoração da futura célula linfocitária, passando de célula tronco na seguinte sequência: pró-linfócito, pré-linfócito, linfócito imaturo, linfócito maduro e linfócito efetor.
A maturação de afinidade ocorre em linfócitos B maduros nos centros germinativos dos linfonodos e se baseia no processo de hipermutação somática, com um aumento da taxa mutacional em determinadas partes do DNA nessas células e Seleção clonal.
Todos os linfócitos se originam na medula óssea vermelha, mas os linfócitos T completam a sua maturação no timo, enquanto os linfócitos B saem da medula já como células maduras. Por esse motivo, a medula óssea e o timo são chamados órgãos linfoides centrais.
O processo de maturação dos linfócitos no timo se inicia com as células pré-T em estágio duplo negativo, ou seja, elas não expressam CD4 ou CD8, nesse estágio ocorre uma intensa proliferação dessas células que passarão por um processo de recombinação VDJ.
Há três tipos de respostas possíveis quando um linfócito é exposto ao antígeno para o qual possui receptores: 1. Linfócitos são ativados, proliferam-se e diferenciam-se em células efetoras, gerando resposta imune produtiva. Tais antígenos são ditos '''imunogênicos'''. 2.
Todos os linfócitos surgem de precursores de órgãos linfoides “primários” ou “generativos”. No caso dos linfócitos T, eles são produzidos na medula óssea e depois migram para o timo para maturação (o timo é um órgão glandular localizado atrás do osso do tórax).
Linfócitos não reagem de qualquer maneira, fenômeno chamado de '''Ignorância Imunológica'''. Com relação à tolerância centraldos linfócitos T, o principal mecanismo é a “seleção natural ou deleção” que ocorre da seguinte maneira: Primeiramente o linfócito T imaturo reage
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