No processo de nitrificação, ocorre a oxidação da amônia em nitrito e, na sequência, em nitrato. Esse processo é realizado por bactérias que fazem quimiossíntese, ou seja, que utilizam a energia liberada na nitrificação para sintetizar suas substâncias orgânicas.
Bactérias Desnitrificantes encontram-se em áreas sem luz e oxigênio no aquário, como por exemplo, no fundo de um substrato alto. São chamadas de bactérias anaeróbicas. Estas bactérias utilizam o nitrato para produzirem nitrogênio gasoso que retornará à coluna d'água e depois, pela agitação, irá para atmosfera.
A nitrificação no Ciclo do Nitrogênio é o processo de conversão de amônia em nitritos e nitratos. A maior parte da amônia produzida pela fixação não é absorvida pelas plantas, mas sim oxidada a nitritos e nitratos. As bactérias envolvidas nas duas etapas pertencem aos gêneros Nitrosomonas e Nitrobacter.
No processo de assimilação, o nitrato é reduzido a nitrito no citosol pela enzima redutase do nitrato; posteriormente, o nitrito é reduzido a amônio nos plastídeos da raiz ou nos cloroplastos das folhas pela enzima redutase do nitrito (Tischner, 2000).
As nitrobactérias obtêm energia e azoto por oxidação em cada uma destas fases. A nitrificação é especialmente ativa em solos férteis, arejados e de reação neutra ou ligeiramente alcalina, que proporcionam condições adequadas para os microrganismos nitrificantes.
Esse processo é realizado por bactérias que fazem quimiossíntese, ou seja, que utilizam a energia liberada na nitrificação para sintetizar suas substâncias orgânicas. As bactérias que realizam nitrificação são chamadas de bactérias nitrificantes.
Nitrificantes, como as Nitrosomonas e Nitrosococus, que realizam o processo de nitrosação, e as Nitrobacter, que realizam o processo de nitração; Desnitrificantes, que garantem a liberação de nitrogênio para a atmosfera.
Por fim, há o processo de desnitrificação, em que os compostos nitrogenados encontrados no solo são utilizados pelas bactérias desnitrificantes. Essas bactérias utilizam esses compostos para obtenção de energia e, durante o processo, liberam gás nitrogênio, que é lançado na atmosfera.
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