Durante a peste negra, as cidades contratavam médicos para tratar os doentes. Nem sempre estes eram habilitados ou possuíam estudos de medicina, mas eram aceitos com a esperança de que trariam a cura. No século XVII, os médicos vestiam uma máscara feita de couro e com um bico que se assemelhava ao de uma ave.
O tratamento para qualquer um dos tipos da peste deve ser feito com o uso de antibióticos indicados pelo médico. Durante o tratamento é preciso ficar internado no hospital em um quarto de isolamento, para evitar passar a doença para outras pessoas.
Em 1895 regressou ao Instituto Pasteur em Paris e com Émile Roux, Albert Calmette e Armand Borrel, preparou o primeiro soro anti-peste. No mesmo ano regressou a Indochina, onde instalou um pequeno laboratório em Nha Trang, com o fim de fabricar o soro.
A quarentena mostrou-se muito eficiente como medida para conter a propagação da Peste Negra e tornou-se uma das práticas mais tradicionais de saúde pública. Na imagem, vista tradicional de embarcações às margens de Veneza.
Com a calamidade da saúde pública e higiene, a doença se proliferava de forma mais rápida e para outras regiões. A sociedade tinha o costume de descartar os lixos domésticos pelas janelas, assim como as próprias fezes.
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Além de promover a vacinação dos moradores das áreas mais infectadas, Oswaldo Cruz utilizou-se da notificação compulsória para garantir o isolamento dos doentes e o seu tratamento com o soro fabricado no Instituto Soroterápico Federal.
A situação só mudaria no ano seguinte, quando o Instituto Butantan começou a produzir a vacina antipestosa, seguindo a técnica criada pelo italiano Camillo Terni do Instituto de Messina, a partir da vacina desenvolvida pelo médico russo Waldemar Haffkines.
Em 1894, o cientista franco-suíço Alexandre Yersin e o japonês Shibasaburo Kitasato finalmente identificaram o bacilo da doença. Dois anos mais tarde, o russo Waldemar Haffkine criou uma vacina contra a peste, e, em 1898, Yersin usou os primeiros soros antipestosos em seres vivos.
No final de 1350, a Peste Negra diminuiu, mas ocorreram outros surtos em 1361–1362, 1369, 1379–1383, 1389–1393 e durante a primeira metade do século XV.
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