Assim, para a surpresa de Ash, seu amigo decide que irá capturar Mewtwo, o qual avisa que foi criado para ser o Pokémon mais forte do mundo. O garoto de Pallet pede para batalhar contra ele como forma de avançar em seu sonho de ser um Mestre Pokémon, e o Lendário aceita o desafio dos dois.
Ele foi criado geneticamente em um laboratório, sendo um clone do misterioso antigo Pokémon Mew. Após destruir seus criadores, MewTwo foi levado pela malvada organização Team Rocket, onde seus poderes continuaram a ser explorados, até que ele se revoltou e iniciou seu próprio caminho para encontrar a si mesmo.
Ele Mega Evolui para Mega Mewtwo X ou Y quando entra em contato com uma Mewtwonite X ou Y.
Mewtwo aparece em Pokémon X e Y depois de completar a história principal e é um dos vários Pokémon que é capaz de usar a nova mecânica dos jogos de Pokémon, a Mega Evolução, tornando-se ou Mega Mewtwo X ou Mega Mewtwo Y. Desde sua estreia, Mewtwo tem aparecido em outros jogos da Nintendo.
Como os Pokémon Lendários que vieram antes deles, incluindo Groudon e Kyogre, o Mewtwo de armadura poderá ser encontrado em Raids cinco estrelas, pelo que precisarás de uma equipa de treinadores caso o queiras derrotar.
Apenas uma explicação: Para esquecer o Ataque Frustração, basta usar um MT de Ataque Carregado, não precisa ser um MT de Elite.
Mewtwo é grande, tem longos e finos braços, em cada mão/pata tem três dedos. Sua pele é lilás apenas pela parte da barriga, que é de cor roxa, que se prolonga pelo inteiro.
Os cientistas acharam que Mewtwo estava inconsciente em seu tubo, mas ele conseguia se comunicar telepaticamente com os demais clones. No entanto, como o processo requeria uma grande força de vida, Amber, Bulbasauro, Squirtle e Charmander morreram. O lendário foi o único que sobreviveu, já que Mew é um Pokémon imortal.
Mewtwo não aparece no mapa (Selvagem) e também não é chocado em ovos. Atualmente, você só pode conseguir o Pokémon de duas maneiras: esperar que ele retorne a um dos eventos especiais de Reide ou solicitar a um amigo que o tenha, para que troque com você.
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