O complexo voltou a ser comandado pela maior facção criminosa do Rio de Janeiro, o Comando Vermelho.
Luciano Martiniano da Silva, o Pezão, é o chefe do tráfico no Complexo do Alemão. O criminoso é procurado desde a época da ocupação e continua foragido.
Alemão é o apelido de José Carlos Gonçalves, preso na operação Rei do Crime.
As doze áreas mais críticas de ocupação na cidade do Rio de Janeiro estão espalhadas na Zona Norte, Zona Sul e Zona Oeste. Rocinha, Acari, Cidade de Deus, Mangueira, Turano, Manguinhos, Parada de Lucas, Complexo do Alemão, Complexo da Maré, Jacarezinho, Santa Marta e Vila Cruzeiro.
O Complexo da Penha é considerado quartel-general do Comando Vermelho. Informações das polícias indicam que as principais lideranças da facção estão alocadas na região, como Wilton Carlos Rabello Quintanilha, o Abelha, e Pedro Guedes, o Urso.
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O PCV. O Primeiro Comando de Vitória (PCV) tem sede no Bairro da Penha, que fica na região conhecida como território do bem, e surgiu em 2010, em um modelo parecido com o do Primeiro Comando da Capital (PCC), mas hoje é filiado ao Comando Vermelho (CV).
O Comando Vermelho Rogério Lemgruber, mais conhecido como Comando Vermelho e pelas siglas CV e CVRL, é uma das maiores organizações criminosas do Brasil. Foi criada em 1979 no Instituto Penal Cândido Mendes, na Ilha Grande, Angra dos Reis, Rio de Janeiro.
Parte das lideranças do TCP fundaram o Complexo de Israel, um conjunto de favelas formada pelas comunidades de Parada de Lucas, Cidade Alta, Vigário Geral, Pica-Pau e Cinco Bocas.
O PCC é a maior facção do país, com ação transnacional.