Pra você alterar, você precisaria ter os arquivos baixados dentro da pasta do seu projeto, o que deixaria ele mais lento, é melhor deixar por cdn mesmo. Pra criar sua classe, basta você criar um arquivos css (eu normalmente chamo de custom. css), procura a classe que você desejaria alterar dentro do arquivo bootstrap.
Abra o o Visual Studio Express 2012 for web e no menu FILE clique em New Project; Selecione o template Visual Basic -> Web -> ASP . NET Empty Web Application informe o nome BootStrap_AspNet e clique no botão OK; Vamos agora incluir a referência ao BootStrap em nosso projeto.
Containers. Bootstrap requer um elemento que possibilite envolver o conteúdo do site e adote nosso sistema de grid. Você pode escolher um dos tipos de "containers" para usar em seus projetos. Lembre-se que isso cria um padding a mais, então não deve-se incluir nenhum "container" dentro de outro.
Para estilizar uma tabela com o Bootstrap, basta adicionar a classe table à tag