Quando os enterococos são resistentes à vancomicina o tratamento dependerá do antibiograma: podem ser utilizadas linezolida ou daptomicina e, no caso de Enterococcus faecium também pode ser utilizada quinopristina/dalfopristina. O tratamento cirúrgico é regra em pacientes com endocardite de valva protética.
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Quando se pretende identificar portadores de Enterococcus spp. resistentes à vancomicina (VRE), as amostras indicadas são aquelas obtidas através de coleta de swab anal, swab peri-anal (método de triagem recomendado pelo Centers for Disease Control and Prevention (CDC) ou fezes.
O tratamento depende do local da infecção e da extensão da resistência aos antibióticos. Opções antibióticas empíricas para ITU devido a E. coli e outras enterobactérias podem incluir quinolonas, sulfametoxazol-trimetropim, amoxicilina-clavulanato e nitrofurantoína.
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